杀生剂又称杀菌灭藻剂、抑制菌剂或杀菌剂等，投加杀生剂是目前循环水微生物控制较为成熟、有效的方法之一。杀生剂可分为氧化性杀菌灭藻剂和非氧化性杀菌灭藻剂两大类。常用氧化性杀菌灭藻剂：1、氯和次氯酸盐。氯是最常用的杀菌剂，具有高效、快速、广谱、经济、使用方便等特点，对动物性浮游生物和细菌类特别有效，一般只要有0.5~1mg/L余氯维持就可以抑制冷却水中大部分微生物。2、二氧化氯（ClO2）。用二氧化氯作杀菌剂具有剂量小、作用快、效果好的优点。它是一种强氧化剂，其氧化杀生能力是氯的25~26倍。3、氯化异氰尿酸。通常使用的是二氯化异氰尿酸钠（DCCNa，商品名为优氯净）、二氯化异氰尿酸钾（DCCK）及三氯化异氰尿酸（TCCA，商品名为强氯精）。浓度在30~40mg/L杀生效果较好。4、溴及溴化物。溴为棕红色发烟液体，其性质与氯相似，溶于水后反应生成次溴酸，起氧化杀生作用。次溴酸也可电离，电离后生成HOBr和OBr-，而在高pH值的条件下，溴的杀生能力是强于氯的。⑤臭氧。杀生速度较氯快300~600倍，杀生后分解为氧，对环境无任何污染。